Система предназначен для автоматизации процессов формирования, учета, мониторинга назначений и отпуска лекарственных препаратов для медицинского применения гражданам, имеющим право на обеспечение лекарственным препаратами, медицинскими изделиями и специализированными продуктами лечебного питания за счет бюджетных ассигнований федерального бюджета и бюджетов субъектов Российской Федерации, в том числе с использованием электронных медицинских документов, а также для организации информационного взаимодействия с государственными и региональными информационными системами.
В Системе используется единая федеральная нормативно-справочная информация единой государственной информационной системой в сфере здравоохранения https://nsi.rosminzdrav.ru, единый структурированный справочник-каталог лекарственных препаратов https://esklp.egisz.rosminzdrav.ru, Федеральная информационная адресная система https://fias.nalog.ru/, а также общепринятые международные и федеральные справочники, использование которых регламентировано Минздравом России. Использование региональных справочников допускается только при отсутствии необходимых сведений в выше указанных справочниках. Сведения о медицинских организациях, медицинских работниках вносятся в систему на основании данных, получаемых из ФРМР и ФРМО.
Система может использоваться как самостоятельно, так и в качестве Подсистемы государственной информационной системы в сфере здравоохранения региона.